Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CECR2Q9BXF3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms