Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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RABGGTAQ92696 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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RABGGTAQ92696 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
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RABGGTAQ92696 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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