Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6K3

PTAR1, Protein prenyltransferase alpha subunit repeat-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAR1Q7Z6K3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAR1Q7Z6K3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms