Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms