Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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