Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRMS1LQ5PSV4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRMS1LQ5PSV4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BRMS1LQ5PSV4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRMS1LQ5PSV4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRMS1LQ5PSV4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRMS1LQ5PSV4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRMS1LQ5PSV4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRMS1LQ5PSV4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRMS1LQ5PSV4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRMS1LQ5PSV4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRMS1LQ5PSV4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRMS1LQ5PSV4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRMS1LQ5PSV4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRMS1LQ5PSV4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRMS1LQ5PSV4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRMS1LQ5PSV4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BRMS1LQ5PSV4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRMS1LQ5PSV4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRMS1LQ5PSV4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms