Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106017.1-201ENST00000428348 440 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007952.3-201ENST00000442355 440 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007952.8-202ENST00000495691 440 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHD-202ENST00000613640 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AL049792.1-201ENST00000424708 1262 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 GOLGA2-210ENST00000490628 428 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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KRTAP21-3Q3LHN1 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AC020909.3-201ENST00000598194 375 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AC147067.2-201ENST00000608161 289 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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