Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms