Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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