Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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