Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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