Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB35Q15286 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms