Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms