Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms