Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms