Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B2Q01814 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms