Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms