Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms