Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms