Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK8P49336 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK8P49336 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK8P49336 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK8P49336 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK8P49336 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms