Protein–RNA interactions for Protein: P33121

ACSL1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL1P33121 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL1P33121 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms