Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms