Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO2P25791 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO2P25791 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO2P25791 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO2P25791 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO2P25791 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO2P25791 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO2P25791 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO2P25791 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO2P25791 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms