Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms