Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL2P13500 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL2P13500 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL2P13500 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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