Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOP08100 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHOP08100 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RHOP08100 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHOP08100 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHOP08100 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms