Protein–RNA interactions for Protein: P02675

FGB, Fibrinogen beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGBP02675 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGBP02675 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FGBP02675 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGBP02675 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGBP02675 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGBP02675 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGBP02675 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms