Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBNO60934 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBNO60934 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBNO60934 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBNO60934 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBNO60934 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBNO60934 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBNO60934 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBNO60934 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBNO60934 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NBNO60934 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NBNO60934 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NBNO60934 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NBNO60934 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NBNO60934 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NBNO60934 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NBNO60934 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NBNO60934 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NBNO60934 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NBNO60934 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NBNO60934 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NBNO60934 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NBNO60934 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NBNO60934 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NBNO60934 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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