Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF103O00237 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF103O00237 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF103O00237 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF103O00237 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF103O00237 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF103O00237 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF103O00237 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF103O00237 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF103O00237 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF103O00237 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms