Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms