Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.05■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS4AQ9UN37 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms