Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms