Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPC1L1Q9UHC9 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms