Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms