Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms