Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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