Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms