Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms