Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms