Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms