Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3KBP1Q96B97 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms