Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms