Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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CLDN19Q8N6F1 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CLDN19Q8N6F1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CLDN19Q8N6F1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CLDN19Q8N6F1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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CLDN19Q8N6F1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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CLDN19Q8N6F1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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CLDN19Q8N6F1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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CLDN19Q8N6F1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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CLDN19Q8N6F1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CLDN19Q8N6F1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CLDN19Q8N6F1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CLDN19Q8N6F1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CLDN19Q8N6F1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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CLDN19Q8N6F1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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