Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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