Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LGALS9CQ6DKI2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LGALS9CQ6DKI2 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms