Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms