Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms