Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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