Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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