Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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